<div dir="ltr"><div dir="ltr">Judith,<div><br></div><div>A few things to take into consideration:</div><div>1. What is the smallest and largest possible species that might form? That will determine your fastest rotor speed (e.g clearance of the optical path)</div><div>2. You can estimate the fastest speed using the equation published in Schuck, P et. al  Basics of Analytical Ultracentrifugation.  The equation is on Pg 213.</div><div>3. You will more than likely need to do a multi-speed SV experiment. This can take a few forms, but I would just do a single concentration at two speeds. Double the concentration and repeat. Another way would be to spin at a low speed, collect data then speed up and collect data. </div><div>4. The reaction kinetics (fast and slow equilibrium) of the interaction will also examined.</div><div><br></div><div>Those are some of the things I can think of off the top of my head. More might come later.</div><div><br></div><div>Lake</div><div><br></div><div>Lake</div><div><p class="MsoNormal" align="center" style="text-align:center;text-indent:0.5in;margin:0in 0in 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:Arial,sans-serif"><span style="font-size:12pt"><span id="gmail-_x0000_t75">
 
 
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 
 
 
</span><span id="gmail-_x0000_i1025" type="#_x0000_t75" style="width:383.1pt;height:42.6pt">
 
</span></span></p>

<p class="MsoNormal" style="text-align:justify;text-indent:0.5in;margin:0in 0in 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:Arial,sans-serif"> </p><p class="MsoNormal" align="center" style="text-align:center;text-indent:0.5in;margin:0in 0in 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:Arial,sans-serif"><span style="font-size:12pt"><span id="gmail-_x0000_t75">
 
 
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
 
 
 
</span><span id="gmail-_x0000_i1025" type="#_x0000_t75" style="width:387.9pt;height:42.6pt">
 
</span></span></p></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, Apr 4, 2019 at 12:35 PM Judith Kornblatt <<a href="mailto:Judith.Kornblatt@concordia.ca">Judith.Kornblatt@concordia.ca</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">><br>
><br>
>> I'm doing active enzyme centrifugation on an olligomeric enzyme, <br>
>> hoping to learn whether or not the individual subunits have activity. <br>
>> I know how to manually analyze the data when there is only one active <br>
>> species, but don't know how to do the analysis if there are multiple <br>
>> active species with different s values. In addition, I'd prefer to <br>
>> not have to do this manually. Any suggestions for the analysis?<br>
>><br>
>> Judith Kornblatt<br>
>> Profesor Emeritus<br>
>> Department of Chemistry and Biochemistry<br>
>> Concordia University, Montreal<br>
>><br>
_______________________________________________<br>
RASMB mailing list<br>
<a href="mailto:RASMB@list.rasmb.org" target="_blank">RASMB@list.rasmb.org</a><br>
<a href="http://list.rasmb.org/listinfo.cgi/rasmb-rasmb.org" rel="noreferrer" target="_blank">http://list.rasmb.org/listinfo.cgi/rasmb-rasmb.org</a><br>
</blockquote></div></div>