<div dir="ltr">Hi Rob-<div><br></div><div>Its been a while since I have been on here and even longer since I have worked with these instruments regularly, so perhaps we can take my answer as a bump to your post - </div><div><br></div><div>That said, interference optics are "seeing" a change in refractive index between the two sides of the cell, although I presume FITC would be different than an amino acid with respect to its concentration effect contribution to the observed signal its probably not a big change if its part of a much bigger protein, and in any case is attached to the protein, so any (possibly- slight- I assume) effect it might have on the interference signal would only show up if your trying to quantitate the protein concentration.  Since its attached to the protein I would begin with the assumption that it will not affect the outcome in terms of the calculated S values etc, beyond whatever effect it has on protein behavior as a macromolecule. </div><div><br></div><div>I will await further discussion as a refresher.  I know I have done this in the past but cannot recall if we observed fringe offsets, I don't think we did, as we were looking at larger proteins and a single FITC would not be a major change, if your working with really small stuff maybe its different, or I may be recalling incorrectly.   </div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jun 2, 2015 at 2:22 PM, Robert Shaffer <span dir="ltr"><<a href="mailto:rshaff@bu.edu" target="_blank">rshaff@bu.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8000001907349px">If I use a FITC-labeled ligand with my protein, will the fluorophore cause any issue with the interference optics</span> for a sedimentation velocity run I plan to do next week? Or, does fluorescein not affect the quality of interference data?<div><br></div><div>Thank you,</div><div>Rob<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr">Robert Shaffer</div><div dir="ltr"><a href="mailto:rshaff@bu.edu" target="_blank">rshaff@bu.edu</a><br>MCBB, PhD Program<br>Boston University<br><div><br></div></div></div>
</font></span></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
RASMB mailing list<br>
<a href="mailto:RASMB@list.rasmb.org">RASMB@list.rasmb.org</a><br>
<a href="http://list.rasmb.org/listinfo.cgi/rasmb-rasmb.org" target="_blank">http://list.rasmb.org/listinfo.cgi/rasmb-rasmb.org</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>