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<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=798423717-22072011><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial>Peter,</FONT></SPAN></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=798423717-22072011><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial></FONT></SPAN> </DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=798423717-22072011><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial>If I am understanding you properly then your optics are 
working just fine. That average intensity is good, and typically the intensity 
varies more than that across the cell. So why do you believe something is 
wrong?</FONT></SPAN></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=798423717-22072011><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial></FONT></SPAN> </DIV>
<DIV dir=ltr align=left><SPAN class=798423717-22072011><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial>John</FONT></SPAN></DIV><BR>
<HR tabIndex=-1>
<FONT size=2 face=Tahoma><B>From:</B> rasmb-bounces@rasmb.bbri.org 
[mailto:rasmb-bounces@rasmb.bbri.org] <B>On Behalf Of </B>Peter Edward Prevelige 
Jr<BR><B>Sent:</B> Friday, July 22, 2011 9:52 AM<BR><B>To:</B> 
rasmb@rasmb.bbri.org<BR><B>Subject:</B> [RASMB] Intensity Scan 
Help<BR></FONT><BR></DIV>
<DIV></DIV>
<DIV class=WordSection1>
<P class=MsoNormal>Hi All<o:p></o:p></P>
<P class=MsoNormal><o:p> </o:p></P>
<P class=MsoNormal>We are still having problems with our XL-A.  I have run 
intensity scans across an empty rotor hole at 280  (counterbalances in pos 
2 & 4, scan cell 3). I’m not sure I set it up right  but if I did the 
intensity averages 6700 but varies from about 6500 to 7500. Apart from much 
lower noise fluctuations it appears that the reference and sample land on top of 
one another at all points.  What sort of variation should I be seeing with 
radial distance. <o:p></o:p></P>
<P class=MsoNormal><o:p> </o:p></P>
<P class=MsoNormal>What sort of tests should I be doing to evaluate the optical 
system?<o:p></o:p></P>
<P class=MsoNormal><o:p> </o:p></P>
<P class=MsoNormal><o:p> </o:p></P>
<P class=MsoNormal>Thanks<o:p></o:p></P>
<P class=MsoNormal><o:p> </o:p></P>
<P class=MsoNormal>Peter<o:p></o:p></P>
<P class=MsoNormal><o:p></o:p></P>
<P class=MsoNormal><o:p> </o:p></P>
<P class=MsoNormal><SPAN style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt">Peter 
E. Prevelige Jr.<o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN 
style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt">Professor<o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt">Dept. 
of Microbiology, BBRB 416/6<o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt">Univ. 
of Alabama @ Birmingham<o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt">845 
19th St. South<o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN 
style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt">Birmingham AL. 
35294-2170<o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt">Phone 
205 975-5327<o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt">FAX 
205 975-5479<o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt"><A 
href="mailto:prevelig@uab.edu">prevelig@uab.edu</A><o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><SPAN style="FONT-FAMILY: Consolas; FONT-SIZE: 10.5pt"><A 
href="http://www.microbio.uab.edu/faculty/prevelige/prevelige-p.htm">http://www.microbio.uab.edu/faculty/prevelige/prevelige-p.htm</A><o:p></o:p></SPAN></P>
<P class=MsoNormal><o:p> </o:p></P></DIV></BODY></HTML>