For sure I put the cell inside the rotor with the holes facing towards the axis of rotation. But I am not exactly sure if the leakage occured through the feeling hole or between the centerpiece and windows. I have seen spots of dried sample on the ouside surface of windows but I don't remember seeing any circular line at the wall of the centrifuge chamber. I have seen marks of leaked sample at the bottom of the rotor where it supports the cell. So in my understanding it is very likely that the leakage has occured between the windows and the centerprice. One thing I must have to say is that our centerpices are old and they might have some scratches or damages that are not clearly visible through naked eyes. As Dr. Philo mentioned it might be that in presence of protein the surface tension of the sample became low enough to leak through the defects of the centeriece<br>
<br>
<div class="gmail_quote">On Fri, Jun 12, 2009 at 4:51 PM, sumit goswami <span dir="ltr"><<a href="mailto:ikant11@gmail.com" target="_blank">ikant11@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div>Dear all</div>
<div>            we have been trying do some sed-velocity experiments for last couple of weeks but every time we tried most of the cell assemblies leaked!! Apparently it seemed like a simple problem of aging of center pieces but then very recently I ran all the seven cell assemblies overnight at 50000rpm with water in them and none leaked! After that I used the same set of assembly for running my sample by sucking off the water from them  and 4 out of 5 leaked even at 4000rpm. We have used different kinds of buffer so far... PE (5mM Na-phosphate, 1mM EDTA), TE (10mM Tris, 1mM EDTA), Poly buffer (MES,tris, acetate). All of our buffer had 0.01%PEG in them. We have tried both PH 5 & 8.</div>

<div>   Can anyone suggest what's going on? We are ready to buy new centerpiece but not sure if that's the problem. The result with water is confusing us!</div>
<div> </div>
<div>Thank you very much!</div>
<div> </div>
<div>Regards,</div>
<div>Sumit </div></blockquote></div><br>