<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD><TITLE>Re: [RASMB] Hb tetramer</TITLE>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.6001.18183" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV dir=ltr align=left><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=878221716-04022009>Mitra,</SPAN></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=878221716-04022009></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV dir=ltr align=left><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=878221716-04022009>My recollection is that IHP does cause a slight 
compaction of the structure, but I agree with Arthur that 1.08 sounds a bit low. 
I'm wondering whether that might be because you are not using an accurate vbar 
value. I wasn't doing AUC back in the dark ages when I worked on hemoglobin, but 
I vaguely recall that the additivity rule for vbar may not work well for heme + 
globin. I think you will find the experimental vbar in hemoglobin AUC 
papers by Stuart J. Edelstein (? '60s-'70s).</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=878221716-04022009></SPAN></FONT> </DIV>
<DIV><FONT face=Arial color=#0000ff size=2><SPAN 
class=878221716-04022009>John</SPAN></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr align=left><BR></DIV>
<DIV class=OutlookMessageHeader lang=en-us dir=ltr align=left>
<HR tabIndex=-1>
<FONT face=Tahoma size=2><B>From:</B> rasmb-bounces@rasmb.bbri.org 
[mailto:rasmb-bounces@rasmb.bbri.org] <B>On Behalf Of </B>Arthur 
Rowe<BR><B>Sent:</B> Wednesday, February 04, 2009 6:45 AM<BR><B>To:</B> 
mitrana@mail.utexas.edu; rasmb@server1.bbri.org<BR><B>Subject:</B> Re: [RASMB] 
Hb tetramer<BR></FONT><BR></DIV>
<DIV></DIV>
<BLOCKQUOTE>Hi Mitra<BR><BR>An f/f0 value of 1.08 (±?) is low-ish, but within 
  the ball park range for 'globular' proteins. I don't imagine that 2 mM 
  Inositol would affect the (properly and fully corrected) s value. 
  <BR><BR>Regards<BR><BR>Arthur<BR><BR></BLOCKQUOTE><BR>
<BLOCKQUOTE><TT>Hello All<BR>Two questions, related ones -<BR><BR>1. Is a 
  S20,w value of 5.01 too high for a DEOXY Hb tetramer of 67180  <BR>Da MW? 
  This gives a f/f0 of around 1.08. Just a reminder that deoxy Hb 
   <BR>tetramer does not dissociate to a dimer much (dissociation constant 
  ~  <BR>10^-11 M).<BR><BR>2. can such an anomaly occur due to Hb 
  interactions with the  <BR>components of the buffer - in this case 2 mM 
  of Inositol  <BR>hexakisphosphate (IHP)?<BR><BR>Glad to hear any comments 
  and/or references to 
  papers.<BR><BR>Mitra<BR>_______________________________________________<BR>RASMB 
  mailing 
  list<BR>RASMB@rasmb.bbri.org<BR>http://rasmb.bbri.org/mailman/listinfo/rasmb<BR></TT></BLOCKQUOTE><TT><BR></TT><BR>
<P>This message has been checked for viruses but the contents of an attachment 
may still contain software viruses, which could damage your computer system: you 
are advised to perform your own checks. Email communications with the University 
of Nottingham may be monitored as permitted by UK legislation. 
</P></BODY></HTML>