<p>Hi Christopher and RASMBers</p><p> </p><p>I had some velocity data
collected with 5% glycerol which I tried to correlate to sedimentation coefficients
as calculated using HYDRO from Small Angle X-Ray Scattering envelopes. I had never
been able to correlate them. But applying Christopher's correction constant my data
fit very well.</p><p>I really think it would be worthy of publishing so that people
(like me) could use this correlations and cite them in the
future!</p><p> </p><p>Best wishes,</p><p> </p><p>Alessandro
</p><p> </p><p> </p><p>--------------------------------------------------------------------------------<br
/>Message    </p><div><span class="041322417-15022006"><font face="Arial">Dear 
Jo,</font></span></div> <div><span class="041322417-15022006"><font face="Arial"
/></span><font face="Arial"><font face="Arial"> </font></font></div><font
face="Arial"><font face="Arial"> </font></font><div><span
class="041322417-15022006"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial">I have done experiment using a pure protein in various concentration
of glycerol (0-10%) as a project to familiar myself with the SEDFIT software a
while back. I also used the same protein and watch how dimer dissociated in the
presence of GuHCl (0-5M) analyzed with the same software. I will share these
results if anyone is interested.</font></font></font></span></div><font
face="Arial"><font face="Arial"> </font></font><div><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></div><font face="Arial"><font face="Arial">
</font></font><div><span class="041322417-15022006"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial">Sucequently, I was interested in how to choose
scan, the # of scan used to get the best fit and analyzed the raw data with both
SEDFIT and DCDT+ and compare these results. I also did some experiments, using a
dimer protein and observe what happen in the presence of various concentration of
denaturant(GuHCl), as mentioned above, but analyzed the raw data with both SEDFIT
and DCDT+ and compare the results. I can also share these results in case anybody
is interested.</font></font></font></span></div><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font><div><span class="041322417-15022006"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial" /></font></font></span><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial">
</font></font></font></font></div><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"> </font></font></font></font><div><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><span class="041322417-15022006">I did these experiments as  an in
house projects, Just </span>t<span class="041322417-15022006">o familiar myself, as
an experimentalist, not theoretician, to observe the pro and con of using these two
softwares. Enough been said.</span></font></font></font></font></font></div><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial">
</font></font></font></font><div><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial">
</font></font></font></font></font></div><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial">
</font></font></font></font></font><div><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><span
class="041322417-15022006">Regards,</span></font></font></font></font></font></font></div><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font><div><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></div><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial">
</font></font></font></font></font></font><div><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><span
class="041322417-15022006">Chris</span></font></font></font></font></font></font></font></div><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"> </font></font></font></font></font></font><div
align="left" class="Section1"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial">
</font></font></font></font></font></font><p align="left" style="margin-top: 0px;
margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
size="3"> </font></font></font></font></font></font></font></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial">
</font></font></font></font></font></font></font><p align="left" style="margin-top:
0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font size="3">
</font></font></font></font></font></font></font></font></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial">
</font></font></font></font></font></font></font></font><p align="left"
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
size="3"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font></p><span
style="font-size: 10pt; font-family: Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial">  
</font></font></font></font></font></font></font></font></font><p align="left"
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 10pt; font-family: Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial">--------------------------------------------------------<span
class="205401418-09082005">----</span></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font><p
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 12pt"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font size="2">Christopher
Chin</font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font><p
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 12pt"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font size="2">Manager,<span
class="205401418-09082005">  Macromolecular Assembly
Core</span></font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font><p
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 12pt"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font size="2">Sealy Center for
Structural Biology  and <br />Molecular Biophysics
</font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font><p
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 12pt"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font size="2"><font
color="#000080"><font color="#000000">Department of Biochemistry & Molecular   
Biology</font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font><p
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 12pt"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font size="2">5134 MRB.
rt1055</font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font><p
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 12pt"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font size="2">UTMB, Galveston,
TX  </font><a href="mailto:cchin@utmb.edu"><font
size="2">cchin@utmb.edu</font></a><font size="2">,
</font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font><p
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 12pt"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font size="2">409-772-1693,
efax 
630-604-3416</font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"> </font></font></font></font></font></font></font></font></font><p
style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px" class="MsoNormal"><span
style="font-size: 12pt"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
size="2">--------------------------------------------------------<span
class="205401418-09082005">-----</span></font></font></font></font></font></font></font></font></font></font></span></p></span></div><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial">
</font></font></font></font></font></font></font></font></font><div><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial">
</font></font></font></font></font></font></font></font></font></div><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font face="Arial"><font
face="Arial">RASMB mailing list   RASMB@rasmb.bbri.org  
http://rasmb.bbri.org/mailman/listinfo/rasmb      <br /><br /><br /><br /><br
/></font></font></font></font></font></font></font></font></font>