<html>
Assuming that your modifications are simply at the termini, the effect on
vbar should be pretty small even for  relatively short peptides.
Alternatively, it shouldn't be too difficult to use the additivity
principle to calculate vbar for the modified constituents and to then use
these to calculate the overall peptide vbar. There are various tables of
group contributions - the one I have here is in 'Thermodynamic Data for
Biochemistry and Biotechnology' (ed Hinz).<br>
I will admit to simply adding in an extra glycine, on occasion, as an
approximation for the N-Acetyl, C-Amide case, but don't tell
anyone.<br><br>
Regards to all<br>
Richard<br>
<x-sigsep><p></x-sigsep>
<font face="Times New Roman, Times">Dr Richard M Thomas<br>
Institut für Polymere<br>
ETH-Zentrum<br>
CH-8092 Zürich<br>
Switzerland<br>
+41 1 632 5540</font></html>